ندور احداث الفيلم بعد أن يتم حله بأمر من رئيس الولايات المتحدة شخصيًا، يعود فريق (جي. أي. جو) مرة أخرى لكن دون غطاء رسمي للعمل لإنقاذ العالم من خطر محقق، وهذه المرة يفق أعضاء الفريق ضد (زارتان) وأعوانه، الذي يريد السيطرة على العالم من خلال نفوذه.